Trong số bốn dạng đột biến được đưa ra, gây hậu quả lớn nhất về mặt cấu trúc của gen là đột biến mất một cặp nucleotit đầu tiên, vì dạng đột biến này làm dịch khung toàn bộ thông tin mã hóa của gen, ảnh hưởng đến toàn bộ cấu trúc của gen, khiến mARN phiên mã từ gen này có khả năng sai lệch hoàn toàn, thậm chí quá trình phiên mã cũng có thể bị ảnh hưởng, không thể diễn ra được.
Những dạng đột biến còn lại cũng gây ảnh hưởng đến cấu trúc gen nhưng không nghiêm trọng bằng dạng đột biến nêu trên, bởi chúng chỉ gây ảnh hưởng đến một hoặc nhiều nhất là hai bộ ba mã hóa axit amin trên gen.